谁是crispr酶的祖先?—论文—科学网-亚博电竞网站

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作者:张锋等 来源:《科学》 发布时间:2021/9/13 17:11:23
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谁是crispr酶的祖先?

 

过去十年里,科学家已经将crispr系统应用到基因编辑技术中,这是一种用于修改dna的精确和可编程系统。近日,研究人员探索了该系统中使用的一种酶的进化起源,发现一种新的可编程dna修饰系统。

《中国科学报》从美国麻省理工学院和哈佛大学博德研究所获悉,该机构分子生物学家张锋等人发现的这种被称为omega(专性移动元素引导活动)的蛋白质,可能自然地参与重组细菌基因组小片段dna。相关论文近日刊登于《科学》。

研究人员在一个名为iscb的蛋白质家族中发现了omega。这些蛋白质被认为是cas9酶的祖先,在基因组编辑过程中,cas9与rna片段合作,进而引导酶找到并切割特定的dna序列。研究人员发现,每个iscb附近都有一个小rna编码,它指导iscb酶切割特定的dna序列。

“这种rna引导的dna识别机制很可能是大自然多次独立创造的东西。”张锋说,“这些结果表明,有更多有效的可编程系统等待被发现和开发。”

可编程酶,特别是那些使用rna引导的酶,可以迅速适应不同的用途。例如,一直以来,crispr也被认为是一种微生物防御系统,可以让细菌和其他被称为古生菌的单细胞生物通过发送cas9来“咀嚼”病毒和其他基因入侵者的dna。计算机研究表明,cas9可能是从iscb家族进化而来的,该家族由转座子编码,可以在基因组中跳转到新的位置。到目前为止,iscb蛋白的功能还不清楚。

此次,研究人员发现,负责编码iscb的dna通常位于一类rna分子(被称为ωrna)的dna附近。他们还发现,一些iscb可以在ωrna序列指定的位置切割dna,就像cas9及其引导rna一样。

该团队还研究了另一个名为tnpb的蛋白质家族,该家族被认为是cas12酶的祖先。他们发现,在ωrna的引导下,其中一些蛋白质也能切割dna。

该论文第一作者、麻省理工学院分子生物学家soumya kannan说,数据库搜索结果显示,有100多万个基因可能携带tnpb蛋白编码,而且有些生物体含有这些基因的100多个副本。

实际上,iscb基因不仅存在于细菌和古生菌中,还存在于藻类细胞内的光吸收叶绿体中。因而,这也是研究人员首次在真核生物中发现这样的基因组编辑系统。该些结果表明,真核生物比之前认为的更广泛。

此外,该团队发现iscb可以用来切割人类dna,尽管其效率低于crispr-cas9系统。但iscb系统还可以改进,并且iscb的小尺寸可能会使它更适用于某些应用。

澳大利亚国立大学遗传学家gaetan burgio认为,这项研究推动了人们对crispr-cas9系统进化的理解,以及为iscb这样一个普遍的蛋白质家族赋予了可能的功能。他说,“它填补了一个重要的空白:我们并不知道这些crispr系统是如何变成‘基因剪’的。”(来源:中国科学报 唐一尘)

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