近日，上海海洋大学教授胡鹏与宾夕法尼亚大学遗传系hao wu团队在《自然-生物技术》发表论文，探讨了单细胞胞嘧啶甲基化和羟甲基化修饰联合分析技术，并揭示其特异的基因调控作用。
dna胞嘧啶甲基化（5mc）是种重要的表观遗传修饰，参与调控细胞特异的基因表达和维持基因组稳定性等关键过程。tet家族蛋白能将dna胞嘧啶甲基化氧化为胞嘧啶羟甲基化修饰（5hmc），进而实现去甲基化，从而动态地调整基因组的胞嘧啶修饰。然而，传统的亚硫酸盐测序技术难以准确区分5mc和5hmc修饰，限制了在单细胞水平上对这两种dna修饰进行定量检测的能力。
为解决这一问题，研究人员开发了一种名为joint-snhmc-seq的单细胞测序技术，能够同时检测dna 5hmc和5mc修饰。借助这项技术，研究团队分析了大脑皮层中不同细胞类型的5mc和5hmc修饰位点，并深入研究了这两种修饰在不同基因位点上独特的调控机制。研究发现，长基因往往保持较高水平的5mc修饰，但这并不影响其转录水平。
该技术为研究单细胞水平上的胞嘧啶羟甲基化5hmc修饰和真正的胞嘧啶甲基化5mc修饰提供了平台，有望加深对这些修饰在复杂组织中生物学功能的理解。这项合作成果不仅在生物技术领域具有重要意义，也为研究水产动物甲基化和去甲基化修饰提供了前沿的技术手段。（来源：中国科学报 张双虎）
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